重建後的沙頭角口岸將成為純旅檢口岸，以配合落實跨境貨運「東進東出、西進西出」的布局，並計劃實施「合作查驗、一次放行」的通關模式。劉國勳一直倡議用創新的通關模式，提升旅客過關效率，亦希望釋放香港口岸土地用作興建交通交匯處、停車場及其他商業配套，建立人車直達的口岸。